الفيروسات المجنحة والحصبة الألمانية في دفعة Preix Tetra A71CB256A
في مرحلة الفحص لتقييم الملوثات والشوائب في لقاح Priorix Tetra ، برزت عدة قضايا حرجة: الأولى هي عدم اكتشاف فيروس الحصبة الألمانية بمستوى التسلسل المستخدم ؛ نظرًا لأن هذه النتيجة أثارت الشك في أنه قد يكون خطأ في الإجراء المستخدم ، فقد ارتفع مستوى التسلسل بشكل كبير للوصول إلى عمق مرتفع للغاية (تم إنتاج 260 مليون تسلسل). وهكذا تم اكتشاف فيروس الحصبة الألمانية في 114 نسخة ، أي ما يعادل 0.00004 ٪ من إجمالي التسلسل ، ومن خلال القراءة اليدوية للتسلسلات ، كان من الممكن القضاء على أي مصدر للخطأ في البرنامج المستخدم والتأكيد النهائي على وجود الحصبة الألمانية في العينة.
ومع ذلك ، سمح هذا الإجراء أيضًا بتحديد الفيروسات الخاطئة الموجودة في عدد قليل من النسخ ، وما رأيناه هو أن عدد نسخ الفيروسات الخاطئة تجاوز عدد نسخ الحصبة الألمانية. لذلك ظهرت قضيتان أخريان مهمتان لم يتم حلهما:
- هل الحصبة الألمانية الموجودة في اللقاح كافية لإحداث تأثير مناعي أم يمكن اعتبارها عتبة ثانوية (أي تلوث عرضي)؟
- هل الفيروسات المجازفة موجودة بالفعل؟ إذا كان الأمر كذلك ، هل يمكن أن تكون خطيرة؟
فيما يتعلق بالنقطة 1) يمكننا أن نشكك بقوة في قدرة فيروس الحصبة الألمانية الموهن على العمل كمستضد مناعي بسبب العدد الضئيل من النسخ والتوهين الذي يزيد من ضعف فعاليته ، حتى نتمكن من اعتباره لجميع المقاصد والأغراض ملوثًا دون المستوى
فيما يتعلق بالنقطة 2) كشفت قائمة الفيروسات العرضية المكتشفة عن طريق الفحص عن عدد كبير من الفيروسات ، بعد المقارنة مع التسلسلات المودعة في قواعد البيانات الرسمية ، والتي يمكن أن يُنسب تعريفها خطأً بواسطة البرنامج الذي صنفتها ، وذلك بسبب عدم اليقين المتعلق بالعدد المنخفض للغاية من النسخ. كان التحقق اليدوي واحدًا تلو الآخر ضروريًا لتأكيد وجودهم عن طريق برنامج مختلف (بلاست) ، وبالتالي كان من الممكن تأكيد وجود الفيروسات القهقرية الملوثة التالية:
|
فيروس الارتجاع الداخلي المنشأ البشري K |
32 متواليات |
|
الخيول فيروس فقر الدم المعدية |
2 متواليات |
|
فيروس سرطان الكبد الطيور |
2 متواليات |
|
هيرفي-H / env62 |
4 متواليات |
من المعروف أن هذه الفيروسات هي ملوثات لقاح مغامر ، ومخاطرها المحتملة معروفة أيضًا ، وهذا هو السبب وراء مطالبة المصنعين بالتحقق من غيابهم الكامل في اللقاح.
ويترتب على ذلك من خلال هذا التحليل المتعمق لهذا اللقاح تأكيد عدم مطابقة اثنين من الفعالية والسلامة:
- وجود عدد قليل جدًا من النسخ (عتبة) من الحصبة الألمانية
- وجود فيروسات قد تكون خطرة محتملة
أما بالنسبة لتأكيد آثار الجينومات الأخرى الموجودة في بيانات الحمض النووي الريبي (RNA-seq) مثل "الفيروسات البكتيرية والبيئية غير المصنفة" بما في ذلك متواليات فج ، و "فيروس الرنا المزدوج الجديلة" و "فيروسات الرنا غير المصنفة" ، والتي تضم القليل من الجينومات الفيروسية المعروفة ، إن التحليل المتعمق الإضافي ضروري لإظهار المهمة الصحيحة والحضور الفعال. لم يتم تأكيد وجود فيروس التهاب الكبد B من خلال تحليل BLAST.
يوجد أدناه جدول يلخص ما هو موصوف في النص:
* أكد يدويا من قبل برنامج الانفجار
تنزيل: CORVELVA- تحليل متسلسل لفيروسات الحصبة الألمانية وفيروسات التسلسل-Priorix-Tetra.pdf
ترجم من قبل فريق CLiVa - www.clivatoscana.com