تقرير فيروسي من نوع Quasispecies تم اكتشافه في مجموعتي Preix Tetra

تقرير فيروسي من نوع Quasispecies تم اكتشافه في مجموعتي Preix Tetra

هذا التقرير تقني للغاية ، خاصة بالنسبة لـ "المحترفين" ، لكننا نوصي بمشاهدة المستند بأكمله ، والذي يمكنك العثور عليه في الرابط أسفل المقالة ، حيث حاولنا أن نوضح بطريقة بسيطة الأسباب التي تجعل دراسة شبه الأنواع من هذه الأهمية الكبرى. يسمح لتقييم الجوانب المختلفة:

  • إذا كانت الفيروسات الموجودة في اللقاح قادرة على التغيير بشكل لا يمكن السيطرة عليه بين الدفعات ،
  • إذا كان بالإمكان احتواء السكان المتحولة ككل على فيروسات قادرة على التراجع والتطعيم ،
  • ما إذا كان هذا السكان يمكن أن يتصرفوا عن طريق التسبب في ضغط انتقائي على البيئة مما يسبب مقاومة لا مفر منها للقاح.

ماذا وجدنا؟

أكدت النتائج الأولى لتحليل الجينوم لفيروسات اللقاح الموجودة في مجموعتين من بريتيكس تيترا ما يلي:

  • يمكن إجراء تسلسل لجدري الماء (فيروس الحمض النووي) ، فيروسات النكاف والحصبة.
  • لم يكن فيروس الحصبة الألمانية بكمية كافية لتسلسله.
  • من بين الفيروسات الثلاثة المتسلسلة ، لم يكن فيروس الحصبة بكميات كافية لدراسة وجود مجموعات متحولة.

ويترتب على ذلك أن فيروسات جدري الماء والنكاف قد تمت دراستها بتعمق. تؤكد النتائج أن بيانات الأدب تشير إلى وجود شبهات لكلا الفيروسين.

تم تحديد 245 متغيرًا في جينوم لقاح جدري الماء مقارنةً بالجينوم المرجعي المستخدم للتحليل (الجينوم البري لسلالة دوما). من هذه المتغيرات ، 154 هي المتغيرات "الرئيسية" مقارنة بالفيروس البري الذي تدعمه جميع التسلسلات التي تغطي موقع متعدد الأشكال ، بينما البقية 91 هي اختلافات طفيفة (متغيرات الأقليات) ، أي المواقع التي تظهر ، فيما يتعلق بالجينوم المرجعي ، طفرة بتردد أقل من 100 ٪ (عمومًا ما بين 1 ٪ و 80 ٪).

من المقارنة بين المتغيرات الموجودة في المجموعتين ، لا يوجد فرق ، وهذا لأن جدري الماء هو فيروس الحمض النووي مع تردد أقل طفرة.

تم تحديد 40 نوعًا صغيرًا في جينوم لقاح النكاف مقارنة بالجينوم المرجعي المستخدم للتحليل (جينوم لقاح Jeryl-Lynn) ، الأكثر توطينًا في جين NP (بروتين nucleocapsid) ويكون له تأثير منخفض على البروتين (المتغيرات المترادفة ، لا تؤدي إلى تغيير الأحماض الأمينية) أو معتدلة (متغيرات "missense" أي التي تؤدي لتغيير الأحماض الأمينية ، أو إلى طفرات غير مرادفة) في البروتين المشفر.


تنزيل: CORVELVA-تقرير ما يقرب من الأنواع-Priorix-Tetra.pdf