תובנות על רצפי חומצות גרעין (DNA ו- RNA) הקשורים לשבר L1 של הגנום HPV בגרדסיל 9

תובנות על רצפי חומצות גרעין (DNA ו- RNA) הקשורים לשבר L1 של הגנום HPV בגרדסיל 9

הדו"ח הקודם בנושא ניתוח metagenomic של Gardasil 9 חשף את נוכחותם של שברי L1 מגנום נגיף ה- HPV, אך לא חקרנו לאילו סוגים של נגיף הפפילומה הם שייכים (החיסון מכיל זנים 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, 58).

הניתוח בפרוטאומיקה על ידי LC-MS העלה כי חסרים זנים 11 ו- 58, מה שמעלה ספק לגבי יעילות החיסון, ולמעשה נוכחותם יכולה להיות פרשנויות שונות:

  1. נוכחות של סף תחתון של החלבון האנטיגן;
  2. החלבון קיים בחלק הלא מזוהה מכיוון שהוא קשור כימית לאלומיניום ולכן אינו ניתן לעיכול ובלתי מסיס (אנו חוששים כי חוסר העיכול במבחנה מתרחש גם ב- vivo והדבר ימנע היווצרות נוגדנים ספציפיים כנגד האנטיגן הפרוטאטי בחיסון) , שצריך להיות מפוצל לפפטידים קצרים על מנת לעורר את תגובת הנוגדנים הנכונה);
  3. היעדר חלבון.

בכל מקרה ומקרה התגובה החיסונית יכולה להיות חלקית או בטלה (בדו"ח הסבר קצר כיצד מתרחשת התגובה החיסונית).

להזכיר שכדי לקבל את התגובה החיסונית ההומורלית, המובילה להיווצרות נוגדנים המתרחשת לאחר החיסון, יש לעכל את האנטיגן ולחשוף אותו על קרום התאים המציגים את האנטיגן (APC).

להזכיר כי תהליך הכנת החיסון כרוך בסינתזה רקומביננטית של חלבוני ה- L1 העיקריים של הקפסיד המורכבים בעצמה בקליפה של 72 כובעי פנטאמר ליצירת חלקיקים ויראליים (VLP). הנגיף המפורסם דומה מאוד לנגיף הפפילומה האנושי, והוא מאוד אימונוגני.


הניתוח שלנו אישר את הדברים הבאים:

  • מהמחקר במטגנומיקה של שברי L1 של זני החיסון ל- HPV נמצא כי הזן 58 נעדר הן כ- DNA והן כ- RNA, הדבר עשוי להיות מאותן סיבות אשר לא נמצא החלבון, כמו גם ה- DNA הקשר עם האלומיניום (כפי שהוכיח במחקריו על ידי פרופסור לי שהוזכר בהמשך בפתקים) יכול היה להפריש את רצף רצף ה- RNA או שאולי האנטיגן חסר.

  • היעדר DNA ונוכחות RNA לסוגים 16, 6, 11, 33, 52, 45, 31 מעידים על כך שהזנים קיימים ויש הוכחות גם בניתוח עם LC-MS עם גילוי חלבונים, למעט זן 11. .

  • Ppo Strain 20 אינו מצוין בגליון הנתונים, כך שהוא יכול להיחשב כמזהם פוטנציאלי.

  • עותקי וירוסים של וירוסים המכונים וירוס הפפילומה האנושי והפפילומה המוחזקת הם חתיכות של שברי L1 שלא ניתן לייחס לזן מסוים.

  • למידע נוסף, רצפי שברי ה- L1 שנמצאים במספר העותקים הגדול ביותר הוקפו ברצף, כלומר זנים 18, 16 ו- 6 ואושרו.

  • ההשלכות הקשורות לנוכחותם של שברים אלו הן אלה שכבר דיווחו על ידי פרופ '. לי במחקריו, היינו שנוכחותו של אלומיניום מייצבת את השפלה, משפרת את יכולתו להפעיל תגובה דלקתית רבת-עוצמה לטווח הארוך ולהועבר דרך מערכת הלימפה למקרופאגים במחוזות שונים בגוף.

לסיכום

  • היעדר זן 58 מאושר.
  • רק ה- RNA נמצא בזן 11 ועם מספר נמוך מאוד של קריאות (6 קריאות).
  • 545 קריאות של זן 20 הן זיהום סביר שמעיד על אי התאמה לגיליון הטכני.

הורדה: CORVELVA-תובנות-רצפי-HPV-L1-גנומי Gardasil-9.pdf


תורגם על ידי צוות CLiVa - www.clivatoscana.com