תובנות על רצפי חומצות גרעין (DNA ו- RNA) הקשורים לשבר L1 של הגנום HPV בגרדסיל 9

תובנות על רצפי חומצות גרעין (DNA ו- RNA) הקשורים לשבר L1 של הגנום HPV בגרדסיל 9

מהדו"ח הקודם על ניתוח metagenomic של Gardasil 9 הנוכחות של שברי L1 מגנום נגיף ה- HPV עלתה, אך לא זוהה לאילו סוגים של נגיף הפפילומה הם שייכים (החיסון מכיל זנים 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, 58).

מניתוח הפרוטאומיקה התברר כי הזנים 11 ו- 58 חסרים, מה שמטיל ספק ביעילות החיסון, למעשה ניתן היה לפרש את ההיעדר במגוון:

  1. עם נוכחות של חלבון אנטיגני אך תחת סף;
  2. עם נוכחות החלבון בחלק הלא מזוהה מכיוון שהוא קשור כימית לאלומיניום ולכן בלתי ניתן לעיכול ובלתי מסיס (יש לנו ספק כי כישלון במבחנה במערכת העיכול מתרחש גם in vivo וזה מונע היווצרות נוגדנים ספציפיים נגד אנטיגן החיסון החלבוני, אשר צריך להיות מפוצל לפפטידים קצרים כדי לעורר את תגובת הנוגדנים הנכונה);
  3. עם היעדר חלבון.

בכל מקרה, התגובה החיסונית עשויה להיות חלקית או בטלה (במסגרת הדו"ח הסבר קצר כיצד מתרחשת התגובה החיסונית).

על מנת שהתגובה תהיה הומורלית, מה שמוביל להיווצרות נוגדנים המתרחשת לאחר החיסון, יש לעכל את האנטיגן ולחשוף אותו על קרום התאים המציגים את האנטיגן (APC).

תהליך הכנת החיסון כולל סינתזה רקומביננטית של חלבוני הקפסיד העיקרי L1 המרכיבים עצמם לקליפה של 72 capsomers פנטאמר ליצירת חלקיקים ויראליים (VLP). הנגיף המפורסם דומה מאוד לנגיף הפפילומה האנושי, והוא מאוד אימונוגני.


מהניתוחים שלנו, האישור הבא אושר

  • מהמחקר שנערך במטגנוומיקה של שברי L1 של זני החיסון ל- HPV, נמצא כי הזן 58 נעדר הן כ- DNA והן כ- RNA, הדבר יכול להיות נובע מאותן הסיבות אשר לא נמצא החלבון, כמו גם רצף ה- DNA ו- הקשר עם האלומיניום עשוי להפריע RNA (כפי שהודגם במחקריו על ידי פרופ 'לי שהובא בהמשך בפתקים), או שאכן האנטיגן חסר.

  • היעדר DNA ונוכחות RNA לסוגים 16, 6, 11, 33, 52, 45, 31 מעיד על כך שהזנים קיימים ונמצא גם בניתוח עם LC-MS עם איתור חלבון, למעט זן 11.

  • זן 20 אינו מוכרז בגליון הנתונים ולכן הוא יכול להיחשב כמזהם פוטנציאלי.

  • עותקים של וירוסים המכונים וירוס הפפילומה האנושי והפפילומאווירידה הלא חתומים הם חלקים משברי L1 שלא ניתן לייחס לזן מסוים.

  • למידע נוסף, שברי ה- L1 שנמצאו במספר העותקים הגדול ביותר, כלומר זנים 18, 16 ו- 6, הוקבעו ואושרו.

  • ההשלכות הקשורות לנוכחותם של שברים אלו הן אלה שכבר דיווחו על ידי פרופ '. לי במחקריו וכי נוכחותו של אלומיניום מייצבת את השפלה, מגבירה את יכולתו להפעיל תגובה דלקתית ארוכת טווח ולהועבר דרך מערכת הלימפה למקרופאגים במחוזות שונים בגוף.

לסיכום

  • אישור היעדר זן 58.
  • מבין הזן 11, רק RNA קיים ועם מספר נמוך מאוד של קריאות (6 קריאות).
  • 545 קריאות של זן 20 הן זיהום סביר שמעיד על אי עמידה ביחס לגליון הנתונים הטכניים.

הורדה: CORVELVA-תובנות-רצפי-L1-גנומי HPV-Gardasil-9.pdf