Vírus adventícios e rubéola no lote Priorix Tetra A71CB256A

Vírus adventícios e rubéola no lote Priorix Tetra A71CB256A

Na fase de triagem para avaliação das contaminações e impurezas da vacina Priorix Tetra, surgiram várias questões críticas: a primeira foi a não detecção do vírus da rubéola com o nível de seqüenciamento utilizado; Como esse resultado levantou a dúvida de que poderia haver um erro no procedimento usado, o nível de seqüenciamento aumentou significativamente para atingir uma profundidade muito alta (260 milhões de seqüências produzidas). O vírus da rubéola foi detectado em 114 cópias, igual a 0.00004% do total de seqüências e, por uma leitura manual das sequências, foi possível eliminar qualquer fonte de erro do software utilizado e confirmar definitivamente a presença de rubéola na amostra.

No entanto, esse procedimento também permitiu identificar os vírus adventícios presentes em um número baixo de cópias, e o que vimos é que o número de cópias dos vírus adventícios excedeu o número de cópias da rubéola. Surgiram então mais duas questões não resolvidas muito importantes:

  1. A rubéola presente na vacina é suficiente para produzir um efeito imunogênico ou pode ser considerada sublimiar (isto é, como uma contaminação acidental)?
  2. Os vírus adventícios estão realmente presentes? Se sim, eles podem ser perigosos?

No que diz respeito ao ponto 1) podemos questionar fortemente a capacidade do vírus da rubéola atenuado de atuar como antígeno imunogênico devido ao número insignificante de cópias e à atenuação que enfraquece ainda mais sua eficácia, para que possamos considerá-lo, para todos os efeitos, como contaminante sublimiar.

No que diz respeito ao ponto 2) a lista de vírus adventícios detectados pela triagem revelou um grande número de vírus, após comparação com as seqüências depositadas nos bancos de dados oficiais, cuja identificação poderia ter sido erroneamente atribuída pelo software que os classificou, devido à incerteza relacionada ao número muito baixo de cópias. Foi necessária uma verificação manual um por um para confirmar sua presença por meio de um software diferente (BLAST) e, assim, foi possível confirmar a presença dos seguintes retrovírus contaminantes:

Retrovírus endógeno humano K

32 sequências

Vírus da anemia infecciosa dos equídeos

2 sequências

Vírus da leucose aviária

2 sequências

HERV-H / env62

4 sequências

Sabe-se que esses vírus são contaminantes adventícios da vacina e seu risco potencial também é conhecido, e é por isso que os fabricantes são obrigados a verificar sua completa ausência na vacina.

Conclui-se que, a partir dessa análise aprofundada desta vacina, são confirmadas duas não conformidades de eficácia e segurança:

  • A presença em um número muito baixo de cópias (sublimiar) de rubéola
  • A presença de vírus adventícios potencialmente perigosos

Quanto à confirmação de traços de outros genomas encontrados nos dados de RNA-seq, como 'vírus bacterianos e ambientais não classificados', incluindo seqüências de fagos, 'vírus dsRNA' e 'vírus de RNA não classificados ShiM-2016', que incluem genomas virais pouco conhecidos, um É necessária uma análise aprofundada adicional para demonstrar a atribuição correta e a presença efetiva. A presença do vírus da hepatite B NÃO foi confirmada pela análise BLAST.

Abaixo está uma tabela que resume o que está descrito no texto:

CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 01
CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 02
CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 03

* Confirmado manualmente pelo software BLAST


Download: CORVELVA-Análise aprofundada de sequências de vírus e vírus da rubéola-Priorix-Tetra.pdf


Traduzido pela equipe do CLiVa - www.clivatoscana.com