Анализ последовательности нуклеиновых кислот (ДНК и РНК), связанных с L1-фрагментом генома ВПЧ в Гардасил 9

Анализ последовательности нуклеиновых кислот (ДНК и РНК), связанных с L1-фрагментом генома ВПЧ в Гардасил 9

Из предыдущего отчета метагеномный анализ Гардасил 9 наличие фрагментов L1 генома вируса HPV появилось, но не было идентифицировано, к какому типу вируса папилломы они принадлежат (вакцина содержит штаммы 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, 58).

Из анализа протеомики выяснилось, что штаммы 11 и 58 отсутствовали, что ставит под сомнение эффективность вакцины, фактически отсутствие можно интерпретировать по-разному:

  1. с наличием антигенного, но подпорогового белка;
  2. с присутствием белка в неидентифицированной части, потому что он химически связан с алюминием и, следовательно, не усваивается и нерастворим (у нас есть сомнения, что неспособность переваривать in vitro происходит также in vivo, и это предотвращает образование специфических антител против антигена белковой вакцины, который необходимо фрагментировать на короткие пептиды, чтобы стимулировать правильный ответ антител);
  3. с отсутствием белка.

В каждом случае иммунный ответ может быть частичным или нулевым (в отчете кратко объясняется, как происходит иммунный ответ).

Для того чтобы ответ был гуморальным, что приводит к образованию антител, как это происходит после вакцинации, антиген должен быть переварен и выставлен на мембрану антигенпрезентирующих клеток (АРС).

Процесс приготовления вакцины включает рекомбинантный синтез основных капсидных белков L1, которые самостоятельно собираются в оболочку из 72 пентамерных капсомеров с образованием вирусных частиц (VLP). Собранный псевдовирус очень похож на нативный вирус папилломы человека и обладает высокой иммуногенностью.


Из нашего анализа было подтверждено следующее

  • Из исследования метагеномики фрагментов L1 вакцинных штаммов HPV было установлено, что штамм 58 отсутствует как в виде ДНК, так и в качестве РНК, это может быть связано с теми же причинами, по которым белок не обнаружен, а также с секвенированием ДНК и РНК может быть затруднена связью с алюминием (как продемонстрировано в его исследованиях профессора Ли, процитированных ниже в примечаниях), или антиген может отсутствовать.

  • Отсутствие ДНК и присутствие РНК для типов 16, 6, 11, 33, 52, 45, 31 указывает на то, что штаммы присутствуют и также обнаруживаются в анализе с LC-MS с обнаружение белка, за исключением штамма 11.

  • Штамм 20 не указан в технических данных, поэтому его можно считать потенциальным загрязнителем.

  • Копии вирусов, называемых вирусом папилломы человека и неподписанным Papillomaviridae, представляют собой фрагменты фрагментов L1, которые нельзя отнести к конкретному штамму.

  • Для получения дополнительной информации фрагменты L1, присутствующие в наибольшем количестве копий, т.е. штаммы 18, 16 и 6, были секвенированы и были подтверждены.

  • Последствия, связанные с наличием этих фрагментов, уже описаны проф. Ли в своих исследованиях и это то, что присутствие алюминия стабилизирует его деградацию, повышая его способность активировать мощный долгосрочный воспалительный ответ и транспортироваться через лимфатическую систему в макрофаги в различных районах организма.

В заключение

  • Отсутствие штамма 58 подтверждено.
  • Из штамма 11 присутствует только РНК с очень низким числом операций чтения (6 операций чтения).
  • 545 считываний штамма 20 являются вероятным загрязнением, что свидетельствует о несоблюдении технических данных.

Скачать: CORVELVA-Insights-последовательность-L1-геном ВПЧ Гардасил-9.pdf