Vírus adventícios e rubéola no lote Priorix Tetra A71CB256A

Vírus adventícios e rubéola no lote Priorix Tetra A71CB256A
(Tempo de leitura: 2 - 3 minutos)

Durante a fase de triagem para avaliação de contaminações e impurezas da vacina Priorix Tetra, surgiram várias questões críticas: a primeira dizia respeito à não detecção do vírus da rubéola com o nível de seqüenciamento utilizado; Como esse resultado duvidava que houvesse um erro no procedimento utilizado, o nível de seqüenciamento foi consideravelmente aumentado até atingir uma profundidade muito alta (260 milhões de seqüências produzidas). Dessa forma, o vírus da rubéola foi detectado em 114 cópias, igual a 0.00004% do total das seqüências e, através de uma leitura manual das sequências, foi possível eliminar qualquer fonte de erro do software utilizado e confirmar definitivamente a presença de rubéola na amostra.

No entanto, esse procedimento também permitiu a identificação de vírus adventícios presentes no baixo número de cópias, e o que foi visto é que o número de vírus adventícios excedeu o número de cópias da rubéola. Surgiram então duas outras questões muito importantes para serem resolvidas:

  1. A rubéola está presente na vacina em quantidade suficiente para produzir um efeito imunogênico ou pode ser considerada sub-limiar (isto é, como uma contaminação acidental)?
  2. Os vírus adventícios estão realmente presentes? Se sim, eles podem ser perigosos?

Quanto ao ponto 1) podemos questionar a capacidade do vírus da rubéola atenuado de atuar como um antígeno imunogênico devido ao número insignificante de cópias e à atenuação que enfraquece ainda mais sua eficácia; portanto, podemos considerá-lo em todos os aspectos um contaminante abaixo do limiar

Quanto ao ponto 2) a lista de vírus adventícios detectados por triagem por comparação com as seqüências depositadas em bancos de dados oficiais continha um número substancial de vírus cuja identificação poderia ter sido atribuída erroneamente pelo software que os classificou, precisamente devido ao grau de incerteza associado ao nível muito baixo. número de cópias. Para confirmar sua presença, foi necessário verificá-los um a um manualmente usando um software diferente (BLAST) e, assim, foi possível confirmar a presença dos seguintes retrovírus contaminantes:

Retrovírus endógeno humano K            

32 sequências

Vírus da anemia infecciosa dos equídeos

2 sequências

Vírus da leucose aviária

2 sequências

HERV-H / env62

4 sequências

Sabe-se que esses vírus são contaminantes adventícios das vacinas e seu risco potencial é conhecido, razão pela qual os fabricantes são obrigados a verificar sua completa ausência na vacina.

Conclui-se que, a partir dessa análise aprofundada desta vacina, são confirmadas duas não conformidades de eficácia e segurança:

  • Presença em número muito baixo de cópias (sublimiar) de rubéola
  • A presença de vírus adventícios potencialmente perigosos

Quanto à confirmação dos traços de outros genomas encontrados nos dados de RNA-seq, como 'vírus bacterianos e ambientais não classificados', que inclui sequências de fago, 'vírus dsRNA' e 'vírus de RNA não classificados ShiM-2016', que inclui genomas virais pouco conhecidos, é mais análises manuais aprofundadas são necessárias para demonstrar a atribuição correta e a presença efetiva. A presença do vírus da hepatite B NÃO foi confirmada pela análise BLAST.

Abaixo está uma tabela que resume o que é descrito no texto:

CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 01
CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 02
CORVELVA Insights sobre a presença de rubéola e vírus adventícios Priorix Tetra 03

* Confirmado manualmente com o software BLAST


Download: CORVELVA-Insights-presence-rubéola-e-vírus-adventícia-Priorix-Tetra.pdf