Poročilo o virusu Quasispecies odkrito v dveh sklopih Priorix Tetra
To poročilo je zelo tehnično, zlasti za "strokovnjake", vendar priporočamo ogled celotnega dokumenta, ki ga najdete na povezavi na dnu članka, kjer smo poskušali na preprost način razložiti razloge, zakaj je preučevanje kvazipedij tako velikega pomena. Omogoča oceno različnih vidikov:
- če se virusi, ki jih vsebuje cepivo, lahko nenadzorovano spreminjajo med serijami,
- če lahko mutantna populacija kot celota vsebuje viruse, ki lahko odvzamejo in okužijo cepljeno,
- ali lahko ta populacija deluje tako, da povzroči selektivni pritisk na okolje in povzroči neizogibno odpornost na cepivo.
Kaj smo našli?
Prvi rezultati analize genoma na cepive proti virusom iz dveh serij Priorix Tetra potrjujejo naslednje:
- Protivirusni virusi (virus virus DNA), mumps in ošpice se lahko zaporedoma zaporedijo.
- Virusa rdečk ni bilo v zadostni količini, da bi jo lahko sekvencirali.
- Od treh sekvenciranih virusov virus ošpic ni bil v zadostni količini, da bi preučil prisotnost mutantnih populacij.
Iz tega izhaja, da so bili virusi norice in mumpsa poglobljeno raziskani. Rezultati potrjujejo literaturne podatke, ki poročajo o prisotnosti kvazi vrste za oba virusa.
V primerjavi z referenčnim genomom, uporabljenim za analizo, je bilo v genomu cepiva proti virusu cepiva ugotovljenih 245 variant (divji genom seva Dumas). Od teh različic je 154 „večjih“ različic v primerjavi z divjim virusom, ki ga podpirajo vse sekvence, ki pokrivajo polimorfno mesto, ostali pa 91 so manjše razlike (manjšinske variante), tj. mesta, ki kažejo glede na referenčni genom mutacijo s frekvenco manjšo od 100% (običajno med 1% in 80%).
Iz primerjave med različicami, ki jih najdemo v dveh sklopih, ne izhaja nobena razlika, ker je вариpox virus DNA z manj pogosto mutacijo.
V genomu cepiva proti mumpsu je bilo ugotovljenih 40 manjših variant v primerjavi z referenčnim genomom, uporabljenim za analizo (Genom cepiva Jeryl-Lynn), ki je najbolj lokaliziran v genu NP (nukleokapsidni protein) in ima majhen vpliv na beljakovine (sinonimne različice, tj. Ki ne vodijo do spremembe aminokislin) ali zmerne (različice "missense", tj. Ki vodijo na spremembo aminokislin ali na ne-sinonimne mutacije) v kodiranem proteinu.