Vaccinegate: MRC-5 الوارد في Priorix Tetra - تسلسل الجينوم الكامل

Vaccinegate: MRC-5 الوارد في Priorix Tetra - تسلسل الجينوم الكامل

تم إجراء هذه التحليلات الأخيرة بفضل المساهمة النشطة للجمعيات الفرنسية رابطة ليبرتي معلومات سانتي (ALIS)، الدوري الوطني لتحرير اللقاحات (LNPLV) والجمعية الأسترالية شبكة مخاطر التطعيم الأسترالية (AVN)، ونحن نشكر.


New generation sequencing have become the preferred tool for in-depth analysis in the field of biology and medical science, especially high precision ones.  Thanks to these tools, we can approach in a more modern and comprehensive way a number of applications such as de novo sequencing, metagenomic and epigenomic studies, transcriptome sequencing and genome re-sequencing.

This last one (re-sequencing) is largely used in human field, both for research and diagnostic purposes and consists of NGS - Next Generation Sequencing  of an entire single genome, to map the Single Nucleotide mutations (SNP), insertions and deletions of more or less long sequences that have occurred in certain locations of the genome, and variations in the number of copies of genomic portions/genes (CNV, Copy Number Variants). 

يساعد هذا الإجراء على فهم آلية تطور بعض الأمراض ، من أجل تحديد اتجاهات العلاج السريري في المستقبل كما في حالة السرطان على سبيل المثال. في الواقع ، من خلال هذه الطريقة ، يمكن فك تشفير التراث الجيني لمريض السرطان بشكل كامل في الأنسجة الطبيعية والسرطانية ، مما يسمح لنا بفهم ما الذي تغير بالضبط داخل الجينوم ، وإذا أمكن ، كيفية التدخل في التدابير المستهدفة.

The  re-sequencing procedure requires that the DNA  of an individual is mechanically broken into small dimension fragments (400-500  base pairs) and artificial DNA parts named adapters are tied to these fragments; adapters make it possible to tie the human DNA  fragments to a glass surface on which the bases reading (A, C, G, T) is performed. The DNA base pairs reading takes place by means of chemical reactions, namely the incorporation of nucleotides that have been marked by fluorescent molecules.  The million sequences (reads) thus obtained are then mapped on the human reference genome by specific software and all the variants are identified comparing the analyzed genome with the reference genome.

This same procedure has been performed on the human genome in Priorix® Tetra lot  n. A71CB256A, genome which belongs to cell line MRC-5 (of fetal origin); the work has been carried out by a company in the USA, that routinely deals with human genome re-sequencing analysis. *

*the name of the laboratory that has performed the analysis will be included in the next formal complaint we will file at the Public Prosecutor of Rome and as well at the Italian and European regulatory bodies. The associations who are filing the analysis funded by Corvelva will be promptly kept up to date with these shocking results too.  We are no denying that we feel, especially as parents, distressed by these results we are reporting - as if what we have found out so far was not enough to worry about.


النتائج

تم العثور على الجينوم المرجعي البشري الذي يتطابق مع قراءات 99.76 ٪ من الحمض النووي للقاح ، وهو ما يعني تقريبا في مجملها. إن الحمض النووي للجنين البشري الوارد في هذا اللقاح هو جينوم واحد كامل ، مما يعني أن اللقاح يحتوي على الحمض النووي الجينومي مع جميع الكروموسومات للفرد الذكر (في الواقع ينشأ MRC-5 من الجنين الذكر).

فيما يلي نتائج تحليل أنواع مختلفة من المتغيرات بالمقارنة مع الجينوم البشري المرجعي.


متغير النوكليوتيدات المفردة (SNP - تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة) والإدخالات / الحذف القصير (InDels)

المتغيرات ذات القواعد الفردية للحمض النووي (DNA) هي أشكال متعددة ، مما يعني طفرات المواد الوراثية لنكليوتيد واحد. 

إن "InDels" عبارة عن إدخالات صغيرة وحذف أقل من 50 نقطة أساس وتشكل فئة مختلفة من المتغيرات الجينومية في الجينوم البشري.

في الجينوم البشري للقاح ، تم تحديد 3.6 مليون SNP (تم الإبلاغ عن 98.31 ٪ منها بالفعل في قاعدة البيانات العامة dbSNP و 61.805 الجديدة ، وهذا يعني الأصلي في هذا الحمض النووي) وحوالي 804.000،89.42 InDels (85.106 ٪ منها ذكرت بالفعل في dbSNP و XNUMX جديد). 

The amount of SNP is in line with what has been reported in literature on/in “typical human genome”, whereas the InDels results in a higher quantity compared to what has been reported by “The 1000 Genomes Project Consortium”  namely 800.000 compared to 600.000.


CNV (نسخ رقم المتغيرات) و SV (المتغيرات الهيكلية)

المتغيرات رقم النسخة (CNVs) هي المتغيرات الجينومية بسبب الاختلافات في عدد نسخ شظايا كبيرة نسبيا (أطول من 50 سنة مضت) بين الجينوم الفردية. هناك نوعان من ملفات CNV: اكتب "ربح" (ربح نسخ) ونوع "ضياع" (ضياع النسخ). تم اكتشاف 218 CNVs في جينوم التطعيم البشري ، منها 82 كانت "مكسب" (تغطي جزءًا من الجينوم حوالي 6.9 مليون زوج أساسي) و 136 CNVs من نوع "الخسارة" (تغطي جزءًا من جينوم حوالي 70 مليون قاعدة).

كما هو موضح من قبل مجموعة مشروع جينوم 1000 في "مرجع عالمي للاختلاف الوراثي البشري (Nature ، المجلد 526 ، 10 أكتوبر 2015)" يحتوي الجينوم البشري النموذجي على 2,100 إلى 2,500 متغير كبير بما في ذلك:

  • 1,000 حذف كبير
  • 160 متغير في عدد النسخ (CNVs)
  • 10 الانقلابات

التي تؤثر معا على قواعد 20 مليون من التسلسل ، والنظر في الإدراج أيضا.

كما هو موضح بالنسبة لـ INDELs القصيرة ، حتى في حالة عمليات الإدراج والحذف الكبيرة ، فإن جينوم اللقاح لا يتماشى مع الجينوم البشري "الطبيعي" ، حيث يتم "إعادة ترتيب" أكثر بكثير من جينوم شخص عادي.


رؤية دائرية للجينوم (مؤامرة السيرك)

يتم عرض تمثيل رسومي لجينوم اللقاح المسمى "مؤامرة السيرك" (يشيع استخدامها لتمثيل جينوم متسلسل) ، إلى جانب ممثل آخر يمثل جينوم أعيد تسلسله من الحمض النووي المستخرج من دم فرد سليم - جين طبيعي "عادي" :

كورفيلفا mrc5 4


معنى الدوائر متحدة المركز

كورفيلفا mrc5 2

7) تمثل الحلقة المركزية أكثر استدلالات SV (المتغيرات الهيكلية) في مناطق exon والربط. TRA (برتقالي ، ترجمة) ، INS (أخضر ، إدراجات) ، DEL (عمليات حذف ، رمادية) ، DUP (مضاعفات ، وردي) و INV (انعكاسات ، أزرق).

6) تمثل الدائرة السادسة استنتاج CNV (المتغيرات رقم النسخ). الأحمر يعني كسب تسلسل الحمض النووي والأخضر يعني الخسارة.

5) تمثل الحلقة الخامسة نسبة SNP في الزيجوت المتجانس (البرتقالي) وغير المتجانسة (الرمادي) في تخطيط الرسم البياني.

4) تمثل الحلقة الرابعة (الخضراء) كثافة SNP في تخطيط المخطط المبعثر.

3) تمثل الحلقة الثالثة (أسود) كثافة INDELs في تخطيط المخطط المبعثر.

2) الحلقة الثانية (أزرق فاتح) تمثل قراءات تغطي في تخطيط الرسم البياني.

1) الدائرة الخارجية (الدائرة الأولى) هي رقم الكروموسوم.   

يمكن أيضًا إجراء مقارنة تقريبية بين الحمض النووي للجنين وحمض خلايا هيلا ، وهو خط الخلية المُخلد المستخدم أيضًا لإنتاج لقاح شلل الأطفال.

كورفيلفا mrc5 5

يرجى ملاحظة أن ترجمات خلايا هيلا الممثلة في مؤامرة السيرك بواسطة خطوط النواة ، تتم إحالتها إلى الجينوم بأكمله (ومن ثم الجزء الترميز وغير الترميز) ، بينما في حالة خلايا التطعيم الجنينية فإنها تشير فقط إلى جينات الترميز . 

There is no need to be a scientist to understand from the circos, simply at a glance, that the vaccine genome is not a genome that can be defined as  "normal". The orange lines intertwined at the center of the circos, not so numerous in the corresponding ring of the "normal" genome, already make sense to the anomaly of this genome.


تحليل متغير في جينات السرطان

يُظهر تحليل المتغيرات SNP و InDels و CNV و SV على 560 جينًا تم اختيارهم لأنهم متورطون في أشكال مختلفة من سرطان الإنسان وجود العديد من المتغيرات "الأصلية" ، وهذا يعني أنهم موجودون ، ولا حتى موجودون في قواعد البيانات العامة ، وبالتالي غير معروف في الأدب. وبعبارة أخرى ، تم تحديد تعديلات مهمة للجينات المعروفة بأنها مرتبطة بأشكال الورم المختلفة ، بالنسبة لجميع الجينات التي تم التحقق منها والبالغ عددها 560 ؛ علاوة على ذلك ، هناك أشكال مختلفة لا تُعرف عواقبها ، ولكنها تؤثر ، على أي حال ، على الجينات المشاركة في تحريض سرطان الإنسان.


النتيجة

الحمض النووي الجينومي البشري الموجود في لقاح Priorix lot. ن. من الواضح أن A71CB256A هو أمر شاذ ، حيث يمثل تناقضات مهمة إذا ما قورنت بجينوم بشري نموذجي ، أي كائن بشري سليم. هناك العديد من المتغيرات غير المعروفة (غير مذكورة في قواعد البيانات العامة) وبعضها موجود في الجينات المشاركة في السرطان. ما هو شاذ أيضًا ، فائض الجينوم الذي يظهر تغييرات في عدد النسخ (CNV) والمتغيرات الهيكلية (SV) ، مثل الترجمة اللغوية ، والإدخالات ، والحذف ، والازدواجية ، وانعكاساتها ، التي يتضمن الكثير منها جينات.

المساهمة المحتملة للعديد من المتغيرات (غير موجودة في الأدبيات العلمية وفي قواعد البيانات العامة) في النمط الظاهري للخلايا المستخدمة لنمو فيروسات اللقاح غير معروفة.


داخل PDF ، ستجد جميع الأفكار المتعلقة أيضًا بتأثيرات التحية والمراسلات مع EMA.


 تنزيل: CORVELVA-MRC-5 الواردة في وPriorix-تترا-الكامل-الجينوم التسلسل