Wirusy przypadkowe i różyczki w partii Priorix Tetra A71CB256A

W fazie przesiewowej oceny zanieczyszczeń i zanieczyszczeń szczepionki Priorix Tetra pojawiło się kilka krytycznych problemów: pierwszą była niewykrycie wirusa różyczki przy zastosowanym poziomie sekwencjonowania; ponieważ wynik ten budził wątpliwości, że może to być błąd zastosowanej procedury, poziom sekwencjonowania został znacznie zwiększony, aby osiągnąć bardzo dużą głębokość (wyprodukowano 260 milionów sekwencji). Wirus różyczki został zatem wykryty w 114 kopiach, co stanowi 0.00004% wszystkich sekwencji, a dzięki ręcznemu odczytaniu sekwencji możliwe było wyeliminowanie dowolnego źródła błędu zastosowanego oprogramowania i definitywne potwierdzenie obecności różyczki w próbce.

Jednak ta procedura pozwoliła również zidentyfikować przypadkowe wirusy obecne w małej liczbie kopii, a widzieliśmy, że liczba kopii przypadkowych wirusów przekroczyła liczbę kopii różyczki. Pojawiły się więc dwa bardzo ważne nierozwiązane problemy:

1. Czy różyczka obecna w szczepionce jest wystarczająca, aby wywołać efekt immunogenny, czy też można ją uznać za podprogową (tj. Jako przypadkowe zanieczyszczenie)?
2. Czy wirusy przypadkowe naprawdę są obecne? Jeśli tak, to czy mogą być niebezpieczne?

W odniesieniu do pkt 1) możemy mocno zakwestionować zdolność atenuowanego wirusa różyczki do działania jako antygen immunogenny ze względu na znikomą liczbę kopii i osłabienie, które dodatkowo osłabia jego skuteczność, dzięki czemu możemy uznać go do wszystkich celów i celów za zanieczyszczenie podprogowe

W odniesieniu do pkt 2) lista wirusów przypadkowych wykrytych przez badanie przesiewowe ujawniła dużą liczbę wirusów, po porównaniu z sekwencjami zdeponowanymi w oficjalnych bazach danych, których identyfikacja mogła zostać błędnie przypisana przez oprogramowanie je klasyfikujące, ze względu na niepewność związaną z bardzo małą liczbą kopii. W celu potwierdzenia ich obecności za pomocą innego oprogramowania (BLAST) konieczna była pojedyncza ręczna weryfikacja, dzięki czemu można było potwierdzić obecność następujących zanieczyszczających retrowirusów:

Wirusy te są znane jako przypadkowe zanieczyszczenia szczepionek, a ich potencjalne zagrożenie jest również znane, dlatego producenci są zobowiązani do zweryfikowania ich całkowitej nieobecności w szczepionce.

Wynika z tego, że z tej dogłębnej analizy dla tej szczepionki potwierdzono dwie niezgodności dotyczące skuteczności i bezpieczeństwa:

• Obecność w bardzo małej liczbie kopii (podprogowej) różyczki
• Obecność potencjalnie niebezpiecznych wirusów przypadkowych

Jeśli chodzi o potwierdzenie śladów innych genomów znalezionych w danych o sekwencji RNA, takich jak „niesklasyfikowane wirusy bakteryjne i środowiskowe”, w tym sekwencje fagowe, „wirus dsRNA” i „niesklasyfikowane wirusy RNA ShiM-2016”, które obejmują mało znane genomy wirusowe, konieczna jest dodatkowa dogłębna analiza w celu wykazania prawidłowego przypisania i skutecznej obecności. Obecność wirusa zapalenia wątroby typu B NIE została potwierdzona analizą BLAST.

Poniżej znajduje się tabela podsumowująca to, co opisano w tekście:

* Ręcznie potwierdzone przez oprogramowanie BLAST

Download: CORVELVA-Szczegółowa analiza-sekwencji wirusa różyczki i wirusa-Priorix-Tetra.pdf

Przetłumaczone przez zespół CLiVa - www.clivatoscana.com