Avontuurlijke en rodehondvirussen in Priorix Tetra-batch A71CB256A

In de screeningsfase voor de evaluatie van de verontreinigingen en onzuiverheden van het Priorix Tetra-vaccin kwamen verschillende kritische problemen naar voren: de eerste was de niet-detectie van rubellavirus met het gebruikte niveau van sequencing; aangezien dit resultaat de twijfel deed rijzen dat het een fout zou kunnen zijn voor de gebruikte procedure, is het niveau van sequencing aanzienlijk verhoogd om een ​​zeer hoge diepte te bereiken (260 miljoen geproduceerde sequenties). Het rodehondvirus werd aldus gedetecteerd in 114 exemplaren, gelijk aan 0.00004% van de totale reeksen en door een handmatige lezing van de reeksen was het mogelijk om elke bron van fouten van de gebruikte software te elimineren en definitief de aanwezigheid van rodehond in het monster te bevestigen.

Deze procedure liet echter ook toe om de adventieve virussen te identificeren die in een laag aantal exemplaren aanwezig waren, en wat we hebben gezien is dat het aantal exemplaren van de adventieve virussen het aantal exemplaren van rodehond overschreed. Dus kwamen er nog twee zeer belangrijke onopgeloste problemen naar voren:

1. Is de rodehond in het vaccin voldoende om een ​​immunogeen effect teweeg te brengen of kan het worden beschouwd als een ondergrens (dwz als een onvoorziene besmetting)?
2. Zijn adventieve virussen echt aanwezig? Zo ja, kunnen ze gevaarlijk zijn?

Met betrekking tot punt 1) we kunnen het vermogen van het verzwakte rodehondvirus als een immunogeen antigeen sterk in twijfel trekken vanwege het verwaarloosbare aantal kopieën en de verzwakking die de effectiviteit ervan verder verzwakt, dus we kunnen het in alle opzichten beschouwen als een subdrempelige verontreiniging

Met betrekking tot punt 2) de lijst van onvoorziene virussen die door screening werden gedetecteerd, bracht een groot aantal virussen aan het licht, na vergelijking met de sequenties die in de officiële databases waren gedeponeerd, waarvan de identificatie mogelijk ten onrechte werd toegeschreven door de software die ze classificeerde, vanwege de onzekerheid in verband met het zeer lage aantal exemplaren. Een een-voor-een handmatige verificatie was nodig om hun aanwezigheid te bevestigen door middel van een andere software (BLAST) en het was dus mogelijk om de aanwezigheid van de volgende besmettelijke retrovirussen te bevestigen:

Van deze virussen is bekend dat ze onvoorziene vaccinverontreinigingen zijn en hun potentiële gevaar is ook bekend. Daarom moeten fabrikanten hun volledige afwezigheid in het vaccin verifiëren.

Hieruit volgt dat uit deze diepgaande analyse voor dit vaccin twee non-conformiteiten inzake werkzaamheid en veiligheid worden bevestigd:

• De aanwezigheid in een zeer laag aantal exemplaren (subdrempel) van rode hond
• De aanwezigheid van potentieel gevaarlijke onvoorziene virussen

Wat betreft de bevestiging van sporen van andere genomen die zijn gevonden in de RNA-seq-gegevens, zoals 'niet-geclassificeerde bacteriële en omgevingsvirussen' inclusief faagsequenties, 'dsRNA-virus' en 'niet-geclassificeerde RNA-virussen ShiM-2016' die weinig bekende virale genomen bevat, een aanvullende diepgaande analyse is noodzakelijk om de juiste toewijzing en effectieve aanwezigheid aan te tonen. De aanwezigheid van het hepatitis B-virus werd NIET bevestigd door de BLAST-analyse.

Hieronder vindt u een tabel met een samenvatting van wat in de tekst wordt beschreven:

* Handmatig bevestigd door BLAST-software

Download link: CORVELVA-diepte-analyse-van-rubella-virus-en-virussequenties-Priorix-Tetra.pdf

Vertaald door CLiVa-team - www.clivatoscana.com