Avontuurlijke virussen en rode hond in de Priorix Tetra-batch A71CB256A

Tijdens de screeningfase voor de evaluatie van verontreinigingen en onzuiverheden van het Priorix Tetra-vaccin kwamen verschillende kritieke problemen naar voren: de eerste betrof de niet-detectie van het rubellavirus met het gebruikte niveau van sequencing; omdat dit resultaat de twijfel deed rijzen dat het een fout was in de gebruikte procedure, werd het niveau van sequencing aanzienlijk verhoogd tot het bereiken van een zeer hoge diepte (260 miljoen geproduceerde sequenties). Op deze manier werd het rubellavirus gedetecteerd in 114 kopieën, gelijk aan 0.00004% van het totaal van de sequenties en door een handmatige lezing van de sequenties was het mogelijk om elke bron van fouten van de gebruikte software te elimineren en definitief de aanwezigheid van rubella in de monster.

Deze procedure stond echter ook de identificatie toe van onvoorziene virussen die aanwezig zijn in het lage aantal exemplaren, en wat is gezien is dat het aantal exemplaren van de onvoorziene virussen dat van het aantal exemplaren van rodehond overschreed. Toen kwamen twee andere zeer belangrijke vragen naar voren die moesten worden opgelost:

1. Is de rode hond in het vaccin aanwezig in voldoende hoeveelheid om een ​​immunogeen effect te produceren of kan het als onderdrempel worden beschouwd (dat wil zeggen, als een toevallige besmetting)?
2. Zijn adventieve virussen echt aanwezig? Zo ja, kunnen ze gevaarlijk zijn?

Over punt 1) we kunnen het vermogen van het verzwakte rubellavirus in twijfel trekken om te werken als een immunogeen antigeen vanwege het verwaarloosbare aantal kopieën en de verzwakking die de effectiviteit ervan verder verzwakt, daarom kunnen we het in alle opzichten als een subdrempelige verontreiniging beschouwen

Over punt 2) de lijst van onvoorziene virussen die zijn gedetecteerd door screening door vergelijking met de sequenties die in officiële databases zijn gedeponeerd, bevatte een aanzienlijk aantal virussen waarvan de identificatie ten onrechte kon worden toegeschreven door de software die ze classificeerde, juist vanwege de mate van onzekerheid in verband met de zeer lage aantal exemplaren. Om hun aanwezigheid te bevestigen was het noodzakelijk om ze een voor een handmatig te controleren met behulp van een andere software (BLAST) en het was dus mogelijk om de aanwezigheid van de volgende vervuilende retrovirussen te bevestigen:

Van deze virussen is bekend dat ze onvoorziene verontreinigingen van vaccins zijn en dat hun potentiële gevaar bekend is. Daarom moeten fabrikanten hun volledige afwezigheid in het vaccin verifiëren.

Hieruit volgt dat uit deze diepgaande analyse in dit vaccin twee non-conformiteiten inzake werkzaamheid en veiligheid worden bevestigd:

• De aanwezigheid in zeer laag aantal exemplaren (onderdrempel) van rodehond
• De aanwezigheid van potentieel gevaarlijke onvoorziene virussen

Wat betreft de bevestiging van de sporen van andere genomen die in de RNA-seq-gegevens worden aangetroffen, zoals 'niet-geclassificeerde bacteriële en omgevingsvirussen', waaronder faagsequenties, 'dsRNA-virus' en 'niet-geclassificeerde RNA-virussen, ShiM-2016', dat weinig bekende virale genomen omvat, is verdere diepgaande handmatige analyse is vereist om de juiste toewijzing en effectieve aanwezigheid aan te tonen. De aanwezigheid van het hepatitis B-virus werd NIET bevestigd door BLAST-analyse.

Hieronder staat een tabel met een samenvatting van wat er in de tekst wordt beschreven:

* Handmatig bevestigd met BLAST-software

Download link: CORVELVA-Insights-aanwezigheid-rubella-and-virussen-toevallige-Priorix-Tetra.pdf